Ich habe das früher mit Photoshop gemacht, inzwischen mit Bibble, gleich beim RAW-Konvertieren.
Beides ist natürlich nicht Freeware, aber vielleicht einfach in deinen bestehenden Workflow einzubauen?
Voraussetzung ist (immer), dass du dein Wasserzeichen transparent vorliegen hast, am besten als png (weil skalierbar). Dann pappst du es entweder als Ebene in Photoshop über dein Bild, oder verwendest MarkyPro wenn du mit Bibble arbeitest.
Was du dafür nimmst ist wohl Geschmackssache. Mein Mann hat "Copyright © ..." und seinen Namen da stehen, ich verwende ein grafisches Symbol:
(ein stilisiertes uh als Sinuskurve)