Ah, ich wusste, dass ich etwas vergessen hab.
Werde mich gleich mal ransetzen und meinen Code aufräumen und vielleicht noch die Verbesserungen übernehmen. Das mit den benachbarten Pixel hatte ich mir auch überlegt, mal schaun in wie weit das realisierbar ist. Ich probiere ich es mal fensterbasiert, da man ja eigentlich nur die Umgebung des Pixels braucht.
Zur Not hab ich noch eine C-Bibliothek zur Arbeit mit Genomdaten, da kann man mehrere Gigabyte einlesen.
Gruß, eiq