Ja, das gestackte Bild hat immer einen kleineren Ausschnitt, auch wenn man es mit externen Programmen macht. Modelbau ist ein relativ schwieriger Fall, weil häufig große Fokusunterschiede überbrückt werden müssen - unbedingt vorher ausprobieren, ob die Methode zu den eigenen Erwartungen passt.
Was gut aus der Hand geht ist so was:
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Bild in der Galerie
(und ja, ich weiß dass ich mit der Belichtung nicht aufgepasst habe und der Rotkanal gesättiget ist 
)