Hast du bei beiden die gleiche Stufe eingestellt, also "Fein" oder "Extra Fein"?
Ich bezweifle ohnehin, dass die Unterschiede
erheblich sind. JPEG komprimiert so gut, dass meistens schon ab den mittleren Qualitätsstufen bei wesentlich kleineren Dateigrößen keine Unterschiede feststellbar sind.
Lesenswert zu diesem Thema ist zB:
http://regex.info/blog/lightroom-goodies/jpeg-quality